BLAST

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) je algoritmus používaný v bioinformatice za účelem srovnávání primárních sekvenčních informací, například nukleotidů DNA z různých sekvencí nebo sekvencí aminokyselin z různých proteinů. BLAST umožňuje srovnání dotazované (zadávané) sekvence se sekvencemi v databázi a zároveň rozpoznání obdobných sekvencí nad definovanou hranicí podobnosti. BLAST jako program navrhli Stephen Altschul, Warren Gish, Webb Miller, Eugene Myers, and David J. Lipman z NIH (National Institutes of Health) v USA a publikovali v Journal of Molecular Biology v roce 1990.[1]

  1. ALTSCHUL, S; GISH, W; MILLER, W; MYERS, E; LIPMAN, D. Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology. 1990, s. 403–410. Dostupné online. DOI 10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID 2231712. 

Developed by StudentB